工厂化的层级档次 根据食用菌生产阶段、环节的不同，即菌包（培养基）生产、出菇、产品加工生产三大环节，食用菌工厂化生产可以分段实施，也可以综合实施，进而又可分为食用菌标准化菌包厂、菇厂、菇加工厂，一般以其后产品为该厂定性、定名。有的菌界同仁不认为菌包厂是食用菌工厂化生产的范畴，因其没有后出菇。实际上，作为标准化菌包厂，是否在菇厂里出菇与否并不重要，而其在温控良好的养菌室中养菌，再根据季节生产不同温型的的菌包，供应农户或者菇场出菇，这应该是食用菌工厂化的一种形式，至少是食用菌工厂化生产的初级形式。

食用菌工厂化、现代化、自动化程度，随着现代科技新技术、新设备、新材料的不断应用，会不断提高，工厂化生产在食用菌总产、栽培种类中占有的份额也会不断加大。国外发达国家高度自动化、数字化、智能化的大型菇场固然先进。我国食用菌生产处于小农生产向工业化生产的转型期，我国食用菌生产主体生产方式十分复杂，既有千家万户手工作坊式生产，又有半工厂化化生产场，又有自动化现代菇厂，菇厂规模从小到大相差悬殊。食用菌工厂化研究和推广，我国尚处于初始阶段，必定有一个逐步借鉴创新、消化吸收、循序渐进的过程，不可能一步都跃进为标准化菇厂。而大力发展标准化菌包厂，以我国现阶段食用菌产业发展，是十分必要的，应当得到行业的接受接纳、认可支持。

食用菌工厂化生产 食用菌工厂化生产，是综合现代生物技术、农业技术、环境控制技术、工业技术、现代企业管理学和食用菌基础科学等等现代科技，强势结合形成的工厂化、标准化现代农业生产体系。食用菌工厂化生产本身涉及许多领域的知识，如微生物学、遗传学、生态学、栽培学、气象学，以及制冷、净化、机械、建筑、保温、保鲜、包装等方面技术。