目前世界各国食用菌工厂化栽培品种较单一，欧美是双孢菇，日、韩是金针菇、秀珍菇，我国有四十多个食用菌商品化栽培品种，每个品种又有多种模式，既有草生菌模式又有木生菌模式，既有床栽模式又有袋栽模式，既有室内栽培模式又有园田式栽培模式；三是生产规模和自动化程度的多样化，在向工厂化发展转型的初级阶段，简单生产厂和现代化工厂还将长期共存，互相影响，也会互为补充。在投资建设中，地域、历史、习惯、市场、资金、成本等因素正确论证，确定合理的档次、层次，切不可贪大求洋。

（4）、立体化、单产高：工厂化生产空间利用高于普通大棚空间利用2—4倍，单位面积产量大大提高； （5）、标准化、质量好：标准化生产工艺为食用菌创造了适宜的生长条件，其质量较自然环境条件下要好得多，且达到食品安全标准（无公害、绿色或有机）； （6）、管理先进、有序生产：通过现代企业管理模式，组织员工培训上岗，分工协作，有序生产，生产管理可以通过相关的资质认证； （7）、产品包装加工，品牌销售：优质产品通过适宜的加工包装销往国内外市场，有注册的品牌商标。

工厂化的层级档次 根据食用菌生产阶段、环节的不同，即菌包（培养基）生产、出菇、产品加工生产三大环节，食用菌工厂化生产可以分段实施，也可以综合实施，进而又可分为食用菌标准化菌包厂、菇厂、菇加工厂，一般以其后产品为该厂定性、定名。有的菌界同仁不认为菌包厂是食用菌工厂化生产的范畴，因其没有后出菇。实际上，作为标准化菌包厂，是否在菇厂里出菇与否并不重要，而其在温控良好的养菌室中养菌，再根据季节生产不同温型的的菌包，供应农户或者菇场出菇，这应该是食用菌工厂化的一种形式，至少是食用菌工厂化生产的初级形式。