正确的配制方法如下：一步，要掌握次氯酸钠原液中的有效氯含量：一般含量在10～12％(相当于10万一12万ppm)之间；第二步，根据不同消毒对象及物件，确定需配制消毒液中的有效氯含量，如环境消毒常用有效氯含量0.05％的溶液(相当于500ppm)，餐具消毒常用0.025％的溶液(相当于250ppm)；第三步，按下式算出需配制消毒的原液用量：需配制消毒液的原液用量=配制消毒液中的含氯量配制消毒液量（毫升）原液中含氯量。

杀菌消毒、除藻一直是水体净化、污水治理中的重要步骤。次氯酸钠可以作为消毒剂应用在这个方面。次氯酸钠能杀菌、除藻是因为其可以破微生物细胞膜内的酶系统，影响细胞的生命活动，进而导致微生物的消亡。研究发现次氧酸对大肠杆菌，金黄色葡萄球菌，枯草杆菌有非常明显的灭杀作用。研究了次氧酸钠的除藻能力，发现pH值越低，次氯酸钠的除藻能力越强。同时次氯酸钠浓度越高，对叶绿素a的褪色效果越好，抑制藻类细胞繁殖，达到除藻效果。分析评价了次氯酸钠消毒综合治疗台水路的效果，表示次氯酸钠能灭杀致病菌如铜绿假单胞菌等水样中的微生物，可以用来消毒口腔治疗台的水路系统。

次氯酸钠能破发色基团，在降低有机污染物污水的色度的方面有着很好的效果。陆贤等研究了采用次氯酸钠法深度处理造纸废水的效果，其结果表明COD的去除率超过50%，废水的色度降低了88%左右。陈芳等发现次氯酸钠在光照条件下，浓度为1.25x10-3mol/L时，对亚甲基蓝的有着高达96.60%的降解率，COD的去除率也超过75%。