复合肥但是使用有机肥料也有存在养分含量低，不易分解，不能及时满足作物高产的要求。传统的有机肥的积制和使用也很不方便。人畜禽粪便、垃圾等有机废物又是一类脏、烂、臭物质，其中含有许多病原微生物，或混入某些毒物，是重要的污染源，尤其值得注意的是，随着现代畜牧业的发展，饲料添加剂应用越来越广泛，饲料添加剂往往含有一定量的重金属，这些重金属随畜粪便排出，会严重污染环境，影响人的身体健康。

复合肥单施有机肥3500～7000公斤，9年后土壤有机碳提高0.04%～0.16%，容重降低0.04～0.06克/厘米3，总孔隙度提高1.5%～2.3%，毛管孔隙度提高3.45%～4.05%，田间持水量提高1.13%～1.31%。配合施用氮9.2～18.4公斤的尿素后，上述各项指标比单施有机肥处理明显提高。有机碳比对照提高0.09%～0.19%，容重降低0.03～0.1克/厘米3，总孔隙度提高1.1%～3.8%，毛管孔隙度提高3.45%～5.0%，田间持水量提高2.49%～4.24%。

复合肥中国农业科学院土壤肥料研究所与山东莱阳农学院在山东莱阳进行的9年施用有机肥及有机肥与无机肥配合验结果看出，施用有机肥料对土壤中磷、钾养分平衡有十分重要的作用。 注：CK-不施肥对照；N1-施9.2公斤N/亩；N2-18.4公斤N/亩；M1-有机肥3500公斤/亩(折纯9.2公斤)；M2-施有机肥7000公斤/亩，(折纯N18.4公斤)；M1N1、M1N2、M2N1、M2N2-为有机肥与无机氮肥以不同量相配合的处理