1、企业自我评价。企业应对照《认定办法》第十条的规定进行自我评价，认为符合条件的，按照本通知要求进行申报； 2、网上注册、申报。企业登录“高新技术企业认定管理工作网”进行注册登记，并按要求在网上填写申报材料； 3、税务审核。企业将申报材料报征收企业所得税的主管税务部门审核，由主管税务部门在企业基本信息表上盖章； 4、地方初审。各市科技局会同财政局、国税局、地税局对辖区内企业申报材料进行初审，并形成初审意见； 5、报送材料。各市认定工作机构须正式行文上报材料。上报文件和高新技术企业申报推荐汇总表须加盖科技局、财政局、国税局、地税局公章，连同辖区内企业申报材料（一式二份），由各市科技局在材料报送截止时间前，统一报送至省政务中心科技厅窗口。

第一步为审查与认定；第二步为公示及颁发证书。 组织审查与认定 （1）认定机构收到企业申请材料后，按技术领域从专家库中随机抽取不少于5名相关专家，并将电子材料（隐去企业身份信息）通过网络工作系统分发给所选专家。 （2）认定机构收到专家的评价意见和中介机构的专项审计报告后，对申请企业提出认定意见，并确定高新技术企业认定名单。 上述工作应在收到企业申请材料后60个工作日内完成。

国家高新技术企业认定申报，是一项专业性很强的申报工作，特别是研发费用的归集和研发费用台账的建立，还有材料撰写，都是难点，需要专业的、懂得评审专家口味的项目申报代理机构来完成，如果由企业单独来操作，可能会浪费了许多时间与精力而不得其所。建议可以与专业的高新技术企业认定申报代理机构合作，合肥恒川就很不错，在他们专业的辅导下，往往能收到事半功倍的效果，将大大提高高新技术企业认定申报成功率。