通常制冷机组分为独立制冷机组和非独立制冷机组。从名字来看，两者的区别就已经体现出来了。独立制冷机组有单独的动力输出来源，无论发动机处于什么样的工作状态，它都能在冷藏车中独立工作；而非独立制冷机组不能独立工作，必须依赖发动机提供动力。此外，还有一种比较特殊的冷藏车制冷机组，它只能通电工作，现在不少冷藏车厢也是由这种类型改装而来的，所以车厢里会备有发电机组。独立制冷机组有单独的动力输出来源，即使发动机出现故障，也不会影响制冷工作，确保了车厢中的食物、药品等货物不会变质。但它的价格十分昂贵，且因为结构复杂，维修不易，维修造价也高。

保证车厢里地面的洁净是保证制冷机组正常工作的关键。只有正确的使用和操作好冷藏车，才能够保证货物的完好运送和保存。因为冷藏车是专门用于对温度敏感的产品所使用的，因而温度的保证是冷藏车的关键。如果使用或操作不当，都会导致货物不能在完好的状态下保存或运送。只有正确的使用,定期的保养才能延长冷藏车的寿命。

采用非独立机组的冷藏车一般为城市配送等短途的运输，当然，对于像运输特殊的冷藏车辆除外。中型制冷机：独立式机组独立制冷机组是指冷藏机组具有单独的动力源，即机组本身有独立动力源。一般来说独立制冷机组都是一体式结构但也有改装的分体式结构（此结构一般都是吊装在汽车的大梁上）。大型制冷机：挂车制冷机组大型的制冷机组主要用于半挂冷藏车上，比8X4冷藏车所用的独立机组体积、制冷功率更大。在结构上也与8X4等车辆上使用的独立机组不一样，挂车机组往往被悬挂在挂车的前部，所以在车用制冷机组行业，往往将挂车制冷机组单独划分一类。