小麦种子脱粒机大部分零件由铁制造，因此当脱粒完毕后，需要清洗干净，铲除机器内的杂物尘污，并涂上防锈漆，涂补在使用过程中油漆脱落的区域，对脱焊部分及裂缝进行焊修，查看脱粒机护板罩是否完好，若有损坏需及时更换，并将设备放置在通风干燥的地方。对于螺钉螺纹也要涂油防锈，由于在进行作业时螺母易松动，因此在使用后需及时检查。在停放时要保证设备保持自然状态，不要再小麦种子脱粒机上放置杂物放置设备的变形提前报废，也避免长时间受到压力导致弹簧失去弹性影响使用。

夏季使用小麦种子脱粒机时应当格外留意的便是发动机的温度，避免温度过高影响发动机的功率，导致工作无法正常进行。如果在使用过程中发动机缺水，不要立即注入冷却水，否则将可能致使缸盖或缸体炸裂。我们应当先暂停小麦种子脱粒机的运行，低速运转至水温降低后再慢慢加入冷却水。在高温下作业，风扇皮带将受到影响紧张度降低，造成打滑现象的出现，因此我们可以将其紧张度调整的比标准值略高一些。当然，防止设备发生气阻现象和老化现象都是比较重要的问题，保证小麦种子脱粒机良好的状态才能获取更好的脱粒效果。

由于小麦种子脱粒机滚筒直径较大，转速高惯性大，对修理质量要求很高，因此对于关键性的部件是不得采取焊接修复的，应当及时更换受损部件，以确保脱粒作业的安全。此外，在更换小麦种子脱粒机纹杆时应成套更换，不得只更换几根或是新旧混装，这将可能导致滚筒不平衡，加剧振动，并导致脱粒不干净等问题的出现。小麦种子脱粒机经过检修后应当及时做静平衡试验，在滚筒上预先做出标记，直到标记可以在任何一个位置上停止下来才算是符合要求。此外，发现板栅格破损或是挡风板变形应及时修复更换。